La séance est déterminée en fonction de l'objectif du shiatsu, qui peut prendre 2 formes différentes :

- soit un shiatsu d'entretien et de bien-être (rôle préventif) : le soin s'orientera vers un équilibrage en fonction de la saison (saison énergétique chinoise). Il est d'ailleurs conseillé de recevoir un shiatsu à chaque changement de saison. Cette période de transition est appelée "intersaison" et dure 18 jours. L'objectif est d'aider l'organisme à s'adapter au changement et d'en limiter les impacts. 

- soit un shiatsu destiné à accompagner le traitement de troubles spécifiques tels que : insomnie, difficultés à s'endormir, stress, anxiété, irritabilité, fatigue physique ou morale, troubles liés à la ménopause, problèmes digestifs, manque de dynamisme, tensions ou douleurs physiques, troubles des menstruations, …. Plusieurs séances peuvent alors être nécessaires pour obtenir un résultat satisfaisant. Le nombre de séances et la fréquence dépendent de la nature du trouble et de votre situation personnelle.

Une séance dure environ 1 heure (jusqu'à 1h30 lors d'une 1ère séance). Elle se décompose en 3 temps : un entretien, le shiatsu lui-même et un temps de conclusion.
 
L'entretien a principalement pour objectif de définir vos attentes et d'établir un bilan énergétique qui permet d'orienter le soin à réaliser. Ce bilan est effectué à partir des informations recueillies au cours de l'entretien mais également par une prise des pouls chinois et un examen visuel de la langue. L'ensemble des éléments recueillis au cours de la séance reste strictement confidentiel et ne peut donc être communiqué à un tiers, sauf avec votre accord.

Le shiatsu est réalisé de façon traditionnelle sur un futon et des tatamis installés au sol. Si vous n'êtes pas en mesure de vous allonger au sol, le shiatsu est effectué sur une table de soins. Vous restez habillé au cours de la séance mais il vous est demandé d'apporter une tenue souple et ample (un T-shirt et un jogging fin par exemple) et des chaussettes propres. Une pièce est mise à votre disposition afin de vous changer. 

La séance s'achève par un échange sur le soin donné et sur votre ressenti. Quelques conseils spécifiques peuvent aussi être apportés en fonction des cas.